Depuis janvier 2012, la ville abrite Aix-Marseille Université (AMU).

Cette université unique est issue de la fusion des trois ex-universités d’Aix-Marseille. Aix-Marseille Université, présidée par le Professeur Yvon Berland, est la plus grande université de France en nombre d'étudiants et la première université francophone au monde. Elle a pour ambition de faire partie du club très fermé des 100 premiers établissements supérieurs mondiaux au classement de Shanghai et de faire d’Aix-Marseille la capitale des savoirs du sud de l’Europe. Elle compte aujourd'hui plus de 75 000 étudiants, dont 10 000 internationaux, et couvre tous les champs disciplinaires. La récente labellisation pérenne par l’État de l’initiative d’excellence A*MIDEX, portée par AMU, marque d’ailleurs une étape majeure pour le développement de l’université et de l’ensemble du site d’Aix-Marseille.

L'Université comprend :

• 19 composantes
• 12 écoles doctorales
• 4 000 doctorants, dont 34 % d’étudiants internationaux
• 130 structures de recherche
• 5 grands campus : Marseille Sud-Luminy, Timone, Marseille-Centre, Nord-Étoile, Aix-en-Provence, mais aussi des implantations à La Ciotat, Gap, Digne-les-Bains, Aubagne, Avignon, Arles …
• 54 sites répartis sur 10 villes et 4 départements
• Plus de 150 associations étudiantes

Les composantes d’Aix-Marseille Université (AMU) présentes à Marseille :

• Faculté des arts, lettres, langues et sciences humaines
• Faculté de droit et science politique
• Institut de Management Public et Gouvernance Territoriale / IMPGT
• Faculté d’économie et gestion
• École de journalisme et de communication d’Aix-Marseille / EJCAM
• Faculté de médecine
• Faculté de pharmacie
• Faculté d’odontologie
• École universitaire de maïeutique Marseille Méditerranée
• Faculté des sciences
• Faculté des sciences du sport
• Observatoire des sciences de l’univers - Institut Pytheas
• École Supérieure du Professorat et de l’Éducation / ESPE
• Institut Universitaire de Technologie / IUT
• Polytech Marseille